1. (LP bug: не найден) После попытки редактирования пропадает меню Приложения (Applications), при этом если запустить редактор меню из терминала (команда: alacarte) то получится весьма длинный вывод с сообщением об ошибке.
Решение: удалить пользовательский файл с описанием меню

rm -f ~/.config/menus/applications.menu

2. (LP bug: #154214) Не запускается Менеджер проприетарных драйверов (restricted-manager). При запуске из терминала вываливается c ошибкой. Связано с локализацией системы, поэтому и "очевидный" костыль: заставить программу использовать английскую локаль, для этого выполнить в Терминале:

LANG=C gksudo restricted-manager

"Минус" этого решения - программа будет говорить по-английски.

Можно также решить проблему, подправив файл локализации (русификации).